Разница между установкой MySQL в качестве службы Windows и запуском из командной строки заключается в способе запуска и управления сервером.

Установка MySQL в качестве службы позволяет настроить автоматический запуск при загрузке операционной системы. 14 Если MySQL функционирует в качестве сервиса, то при программном завершении работы компьютера операционная система автоматически завершает работу MySQL-сервиса. 1 При работе в качестве сервиса MySQL не имеет доступа к консоли, поэтому невозможно увидеть его сообщения. 1

Запуск MySQL из командной строки предполагает, что процесс сервера не является самостоятельным и зависит от работы соответствующей программы-оболочки. 3 Например, если запустить сервер MySQL таким способом, а потом закрыть программу-оболочку, то процесс сервера MySQL тоже будет прекращён, и сервер MySQL не будет работать. 3

Таким образом, установка MySQL в качестве службы удобна для частого использования сервера, а запуск из командной строки подходит для ситуаций, когда требуется более самостоятельный запуск и управление сервером.