В чем разница между системными и пользовательскими шаблонами компонентов?

Возможно, имелись в виду шаблоны компонентов в системе 1С:Битрикс. 3

Разница между системными и пользовательскими шаблонами компонентов заключается в том, что системные шаблоны уже готовы к использованию и поставляются вместе с дистрибутивом, а пользовательские — подстроены под назначение конкретного сайта. 13

Системные шаблоны сразу связаны с компонентом и находятся в папке компонента «templates». 3

Пользовательские шаблоны размещаются в папках шаблонов сайтов, например в «/local/templates/шаблон сайта/». 13

Таким образом, системные шаблоны — это стандартные шаблоны, а пользовательские — те, которые адаптированы под определённые нужды.