Разница между системными и фоновыми приложениями на iPhone заключается в их поведении и состоянии:

1. Системные приложения (стоковые) — это встроенные высокопривилегированные приложения, к которым пользователь не может получить доступ. 1 Стандартный каталог их хранения — /Applications/, он статичный и изменяется только во время обновлений системы. 1
2. Фоновые приложения — это приложения, которые, когда их сворачивают и выходят на рабочий стол смартфона, переходят в фоновое состояние. 3 В фоновом состоянии практически все процессы приложения приостанавливаются и не используют ресурсы смартфона, соответственно не расходуют заряд аккумулятора. 3

При этом некоторые системные приложения, например «Почта», могут работать в фоновом режиме бесконечно долгое время. 2