Разница между режимами захвата отдельного окна и полноэкранного приложения в OBS заключается в том, что каждый из них позволяет захватывать разные элементы экрана. 23

Режим захвата отдельного окна позволяет транслировать или записывать только определённое окно (например, браузер или программу). 2 При этом выбранное окно будет отображаться, даже если перед ним открыты другие окна. 3

Режим захвата полноэкранного приложения автоматически обнаруживает любую игру, открытую на весь экран на основном мониторе, и добавляет изображение из неё в источник «Захват игры» в OBS. 3 Если игра развёрнута на весь экран, эта опция будет удобна, так как не нужно выбирать конкретное окно для захвата. 13

Таким образом, выбор между режимами зависит от того, что именно нужно транслировать или записывать.