Возможно, имелись в виду конфигурационные файлы, которые используются для настройки программ и систем. 34

Разница между пользовательскими и системными конфигурационными файлами заключается в их назначении и месте расположения: 1

1. Системные конфигурационные файлы касаются всей системы. 1 Они, как правило, располагаются в корневом разделе и для их изменения необходим доступ суперпользователя. 1 Такие файлы содержат информацию об утилитах и командах системного уровня, которые используются для администрирования и функционирования системы. 1
2. Пользовательские конфигурационные файлы приспосабливают среду к индивидуальным предпочтениям пользователей. 1 Как правило, они располагаются в домашнем каталоге пользователя, и для их изменения права суперпользователя не требуются. 1 Такие файлы позволяют настраивать и адаптировать под себя приложения. 1

Таким образом, системные конфигурационные файлы отвечают за работу всей системы, а пользовательские — за настройку среды с учётом предпочтений конкретного пользователя.