В чем разница между переносимыми и универсальными приложениями?

Возможно, имелись в виду различия между приложениями, предназначенными для разных платформ.

Переносимые приложения используются для выделения общего кода, который отвечает за доступ к данным и бизнес-логику, и может разделяться между несколькими приложениями. habr.com

Универсальные приложения разработаны для работы на разных устройствах, например смартфонах, персональных компьютерах, игровых консолях и HoloLens. ru.frwiki.wiki Такие приложения не указывают в файле манифеста, для какой операционной системы они созданы. ru.frwiki.wiki Вместо этого они нацелены на одно или несколько семейств устройств и реагируют на доступные для них возможности. ru.frwiki.wiki

Таким образом, разница между переносимыми и универсальными приложениями заключается в их назначении: первые используются для общего кода, вторые — для работы на разных устройствах.