Разница между MDF и MDS файлами заключается в их функциях:

• MDF (Media Descriptor File) — образ оптического диска, представляет собой точную копию физического CD/DVD-диска. 12 Может содержать несколько слоёв и дорожек. 1
• MDS (Media Descriptor Sidecar) — метаданные образа оптического диска, в том числе информацию о том, где начинаются и заканчиваются слои диска, и какие части MDF относятся к какому слою. 1

Форматы MDF и MDS разработаны для программы Alcohol. 4 Эти файлы практически неотделимы друг от друга: MDF обычно сопровождается файлом MDS, без которого не распознаётся некоторыми программами-эмуляторами. 5