В чем разница между маршрутизацией через физический порт и через субинтерфейсы?

Возможно, имелись в виду различия между маршрутизацией, осуществляемой через физический интерфейс и через субинтерфейсы.

Физический интерфейс — это объект первого уровня модели OSI, который непосредственно взаимодействует с аппаратным приёмопередатчиком. ftp.nsg.net.ru Физические интерфейсы могут быть встроены в шасси или реализованы в виде сменных модулей и карт. ftp.nsg.net.ru Каждому из таких интерфейсов соответствует один и только один протокольный порт. ftp.nsg.net.ru

Субинтерфейс — это часть физического интерфейса, используемая для одной VLAN. networkengineering.stackexchange.com Обычно субинтерфейсы есть только у маршрутизируемых интерфейсов (L3), которые не участвуют в пересылке (переключении) L2. networkengineering.stackexchange.com

Таким образом, разница заключается в том, что при использовании физического интерфейса все процессы происходят через один интерфейс, а субинтерфейсы позволяют разделять маршрутизацию для разных VLAN на одном физическом интерфейсе.