Разница между клонированием через системные настройки и с помощью сторонних приложений заключается в используемых инструментах и возможностях клонирования.

Клонирование через системные настройки предусмотрено во многих операционных системах, например, в MIUI всех актуальных версий (8 и выше) смартфонов Xiaomi. 1 Для этого нужно перейти в «Настройки», открыть раздел параметров «Приложения», на следующем экране коснуться «Клонирование приложений» и ввести название клонируемого объекта в поле поиска или отыскать его в демонстрируемом на экране перечне. 1

Клонирование с помощью сторонних приложений позволяет создавать дубликаты приложений там, где встроенная функция клонирования не поддерживается или не удовлетворяет потребности пользователя. 27 Для этого нужно скачать и установить приложение, выбрать в нём нужную программу для клонирования и дождаться создания клона. 2

Таким образом, выбор между этими методами зависит от конкретных условий и задач пользователя.