Разница между фактографическими и гипертекстовыми системами управления информацией заключается в том, как они обрабатывают и хранят данные. 13

Фактографические системы хранят не документы, а сведения (факты) об объектах какой-либо предметной области. 13 Фактографические системы обычно используют табличные реляционные базы данных с фиксированной структурой записей. 4 Хранимая и обрабатываемая информация в них представляет сведения фактического характера (справочные, статистические, социальные данные и т. п.). 4 Часто такая информация требует оперативного обновления. 4

Гипертекстовые системы отражают не только содержимое документов, но и их семантическую структуру. 1 В таких системах может быть представлена слабо формализованная совокупность текстов, иллюстраций, аудио- и видеодокументов и т. д.. 1 Гипертекстовая технология предполагает перемещение от одних объектов к другим с учётом их смысловой, семантической связанности. 5 Пользователь сам определяет подход к изучению материала, учитывая свои индивидуальные способности, знания, уровень квалификации и подготовки. 5

Таким образом, фактографические системы фокусируются на хранении и обработке сведений фактического характера, в то время как гипертекстовые системы ориентированы на работу с неструктурированной совокупностью различных информационных материалов.