В чем разница между автоматическим и ручным завершением работы компьютерной программы?

Возможно, имелись в виду различия между автоматическим и ручным выключением компьютера.

Автоматическое завершение работы можно настроить, например, с помощью таймера или сторонних программ. blog.eldorado.ru Пользователь устанавливает время, по истечении которого компьютер должен автоматически отключиться. blog.eldorado.ru

Ручное выключение происходит, когда пользователь самостоятельно закрывает все работающие приложения и службы. dzen.ru Если завершить программу невозможно из-за несохранённых данных, система спрашивает пользователя, нужно ли сохранить информацию. dzen.ru

Таким образом, разница между автоматическим и ручным завершением работы в том, что первое происходит без участия пользователя, а второе — по его команде.