Некоторые преимущества использования патчей Harmony перед другими методами модификации кода:

• Работа только с кодом в памяти. 1 Патчи Harmony не затрагивают файлы на диске, что особенно полезно при работе с вредоносными программами, защищёнными обфускаторами. 1
• Возможность изменения функциональности не только методов одной конкретной сборки, но и всех связанных сборок, в том числе тех, которые входят в состав среды выполнения .NET. 1
• Гибкость внесения изменений. 2 Патчи Harmony позволяют вносить изменения динамически или условно, а порядок их установки может быть гибким. 2
• Сосуществование нескольких патчей без конфликтов. 23
• Меньшее количество конфликтов с несколькими модами. 2 Это связано с тем, что патчи Harmony работают только с изменениями во время выполнения и не влияют на файлы на диске. 2