Отличие системных переменных от пользовательских в Windows заключается в их назначении:

• Системные переменные хранят данные о некоторых каталогах операционной системы и о конфигурации компьютера. 12 Они являются общесистемными и не меняются от пользователя к пользователю. 4
• Пользовательские переменные содержат настройки конкретного пользователя, например, указывают путь до пользовательских каталогов. 2 Они настраиваются по-разному для каждого пользователя. 4

Таким образом, системные переменные доступны для всех учётных записей пользователей, а пользовательские — только тому конкретному пользователю, для которого они были определены. 3

При этом системные переменные имеют меньший приоритет, чем пользовательские: если есть пользовательские переменные с тем же именем, что и системные, то будут учитываться пользовательские. 4