Несколько причин, по которым системный раздел может подвергаться фрагментации:

• Изменения в системе. 1 Например, установка пакета обновлений приводит к фрагментации, так как обновляемые файлы чаще всего не удаётся записать на то же место на жёстком диске. 1
• Операции с файлами. 1 Чтение, запись, изменение, копирование и удаление файлов увеличивают фрагментацию, особенно по мере уменьшения свободного места на диске. 1
• Особенности работы файловой системы. 2 Например, если перед записью нового файла удалить несколько старых, то система начнёт заполнять им свободные области от начала раздела, несмотря на то, что в его конце есть достаточно места, чтобы записать файл в один приём. 2
• Большой размер файла. 4 Если на жёсткий диск сохраняется файл большого размера, который нельзя уместить в один сектор, то он разбивается и сохраняется в несколько секторов. 4

Для уменьшения фрагментации рекомендуется регулярно проводить дефрагментацию диска. 34