Ротаметры не всегда используются в автоматизированных системах измерения по нескольким причинам:

• Визуальное считывание показаний. 23 Обычно показания ротаметра считываются оператором визуально, что усложняет использование прибора в автоматизированных системах. 23
• Вертикальное расположение. 25 Работа ротаметра зависит от силы тяжести, поэтому прибор должен быть ориентирован вертикально. 15 При значительном отклонении ориентации от вертикали может возникнуть значительная ошибка. 1
• Влияние вязкости жидкости. 25 Высота подъёма поплавка-индикатора зависит от плотности и вязкости протекающего вещества. 23
• Влияние вибрации. 5 На точность показаний прибора может влиять вибрация, поэтому рекомендуется применять ротаметры в неподвижных системах. 5

Однако есть предложения по использованию ротаметров в автоматизированных системах, например, с оптическим или магнитным определением положения поплавка. 23