Пропускная способность портов Thunderbolt 3 ниже, чем у PCI-Ex16, из-за меньшей скорости передачи данных. 1 Например, наиболее быстрый Thunderbolt обладает пропускной способностью 40 Гбит/с, в то время как PCI-Ex16 — 126 Гбит/с. 1

Также производительность внешней видеокарты будет ниже при выводе изображения обратно на экран ноутбука, так как это несколько снижает пропускную способность. 2

Кроме того, в некоторых устройствах с Thunderbolt 3 пропускная способность может быть урезана из-за применения дешёвых контроллеров. 2

Ещё одна причина, по которой общая пропускная способность Thunderbolt 3 распределяется между двумя портами на шине, а не на каждый порт отдельно, как в случае с PCI-Ex16. 5