Использование автоупорядочивания в запросах без необходимости нежелательно, потому что разработчик не контролирует, какие именно поля будут использованы для упорядочивания. 2

Автоупорядочивание подходит для универсальных запросов, когда разработчик не может предвидеть, из каких таблиц будут запрашиваться данные, а также в случаях, когда получаемый порядок записей не важен, но при этом он должен быть одинаковым в независимости от применяемой СУБД. 1

Во всех остальных случаях использование автоупорядочивания нежелательно, так как поля, которые являются полями сортировки сегодня, могут перестать быть такими завтра. 1 Например, если завтра изменят настройки базы в конфигураторе и полем сортировки по умолчанию для справочника станет, к примеру, поле Код, то при использовании автоупорядочивания в запросе отчёт сломается, ведь порядок сортировки уже будет другим. 1

Кроме того, использование инструкции АВТОУПОРЯДОЧИВАНИЕ в запросе может сильно замедлять время выполнения запроса. 45