Фрагментация на жёстком диске образуется в процессе активной работы с файлами (создание, удаление, перемещение, изменение размеров). 1 В результате на диске отсутствует достаточное количество последовательных свободных блоков. 1

Записывая новые данные, операционная система пытается найти достаточно большой участок свободного места на диске, чтобы сохранить файл в целостном виде. 1 Однако если файл больше любого из доступных свободных фрагментов или если он продолжает увеличиваться в размере, сохранить его, не разделив на более мелкие фрагменты, невозможно. 1 Система фрагментирует (разделяет) файл, и каждый из меньших фрагментов сохраняется на отдельном участке свободного пространства. 1

Свободный кластер образуется, когда после форматирования диска все кластеры, предназначенные для хранения файлов, помечаются в специальной таблице (FAT) как свободные. 3