Несколько разделов на флешке при создании загрузочного образа могут создаваться из-за особенностей процесса в некоторых программах, например Win32Imager. 1 Во время записи образа в этой программе могут появляться два новых раздела, при этом основной раздел флешки становится неразмеченным. 1

Также создать более одного раздела на флешке стандартными средствами операционной системы Windows, такими как DiskPart, не получится из-за ограничений в самой операционной системе. 4 Для этого используется программа BOOTICE. 4

Чтобы решить проблему, можно попробовать начать создание образа с чистой флешки, стерев все разделы, а затем скопировать образ на неё без изменений в конфиге. 1

Если проблема сохраняется, рекомендуется обратиться к специалисту.