Ил-96-300ПУ считается безопасным самолётом для перевозки президентов по нескольким причинам:

• Отечественное производство. 3 Самолёт сделан силами собственного государства, что важно с точки зрения безопасности и независимости от западных технологий. 13
• Система обеспечения безопасности. 45 Ил-96-300ПУ оснащён радиолокационным, радиотехническим, оптико-электронным и визуальным контролем. 45 Все системы самолёта продублированы на случай возникновения нештатных ситуаций, некоторые даже неоднократно, а некоторые и вовсе полностью заменены другими аналогичными устройствами. 5
• Возможность полёта на одном двигателе. 24 Даже если откажут два двигателя, самолёт сможет набирать высоту, снижаться, маневрировать и выполнять полёт. 24 На одном двигателе лайнер может пройти до 800 километров и приземлиться. 24
• Наличие резервного самолёта. 1 Помимо передового самолёта с охраной, помощниками и журналистами, всегда присутствует резервный. 1 В случае поломки или неисправности, особенно в иностранном аэропорту, президент может пересесть на запасной лайнер. 1
• Комплекс «Президент-С». 1 Он предназначен для индивидуальной защиты самолёта от поражения авиационными и зенитными ракетными системами. 1 Комплекс обнаруживает пуски ракет и активизирует применение пассивных и активных помех в инфракрасных и радиодиапазонах, в результате чего нарушается работа систем самонаведения ракет и производится их перенацеливание. 1