Хакатоны критикуют за недолговечность разрабатываемых решений по нескольким причинам:

• Отсутствие дальнейшей проработки проектов. 1 Многие идеи, рождённые на хакатоне, не получают дальнейшей реализации и превращаются в заброшенные или наполовину реализованные решения. 1
• Невозможность погрузиться в контекст и специфику отрасли. 3 У участников хакатона нет времени и возможности изучить особенности работы отрасли, из-за чего идеи могут быть банальными или неприменимыми в реальной жизни. 3
• Некачественное написание кода. 4 Небольшой проект на несколько дней быстро вырастает в огромную неподдерживаемую, закрытую к модификациям кодбазу сомнительного качества, потому что большинство участников хакатонов не привыкли писать понятный и гибкий код сразу. 4

Однако есть и другая точка зрения: часто хакатоны обладают отложенным эффектом, и иногда идеи, появившиеся на хакатоне, находят своё развитие значительно позже и уже в новом качестве. 1