Несколько причин, по которым файлы на смартфоне могут исчезать после переноса через USB:

• Резкое выдёргивание кабеля. 1 Если вытащить карту памяти в момент, когда на неё будет производиться запись, содержимое кэша не успеет записаться на диск, и данные в файле окажутся неполноценными. 1 После того, как девайс отключён от компьютера, Android запускает сканирование карты и обнаруживает такие «битые» файлы, перемещая их остатки в директорию LOST.DIR. 1
• Неправильная работа функции кэширования. 2 В зависимости от версии Windows на компьютере и типа используемого накопителя, для него по умолчанию может быть включено или отключено кэширование при записи. 2 При включённой опции система не сразу помещает файлы на флешку или карту памяти, а использует оперативную память в качестве кэша. 2 Иногда при неправильной работе функции кэширования файлы сами удаляются после извлечения. 2
• Аппаратная неисправность накопителя. 2 Стоит проверить его работу на других устройствах, и если там наблюдается то же самое, вероятность поломки велика. 2

Чтобы избежать потери файлов при переносе, рекомендуется перед отключением девайса от компьютера выбирать «Безопасное извлечение» и в самом устройстве «Отключить USB-накопитель». 1