Можно подключить две станции Алиса к одному акаунту, но с разными вайфай?

Да, можно подключить несколько Яндекс Станций к одному аккаунту, при этом для каждой из них указать необходимую сеть Wi-Fi. yandex.ru

Однако настроить стереопару или мультирум для одновременного воспроизведения музыки таким образом не получится — для этого колонки должны быть подключены к одному роутеру или к любой другой сетевой конфигурации с общей локальной сетью. market.yandex.ru