Преимущества использования Flatpak по сравнению с другими системами управления пакетами:

• Безопасность. 12 Приложения Flatpak работают в песочнице, изолированы от системной среды, что делает их безопасными для машины пользователя. 2
• Меньший объём пакетов. 1 При обновлении пакета скачивается не весь пакет целиком, а только изменения. 1
• Прямая совместимость. 5 Пакеты Flatpak создаются с учётом ядра операционной системы и среды выполнения, поэтому даже при обновлении дистрибутива они продолжают работать, если не будет обновления ядра. 5

Недостатки использования Flatpak:

• Большие объёмы пакетов. 2 Они обычно занимают больше места, чем софт Snap или AppImage. 2
• Некоторые приложения из Flathub работают не так гладко, как нативные. 1 Например, может не отображаться иконка в трее. 1
• Рантайм занимает дополнительное место. 1
• Мало приложений, хотя есть все популярные. 1
• Не работают proxychains и подобные утилиты. 1

Выбор между Flatpak и другими системами управления пакетами зависит от конкретных требований и предпочтений пользователя.