Файловая система FAT16 поддерживается множеством устройств хранения данных, среди которых: жёсткие диски, флэш-накопители, карты SD, MMC, SDXC, внутренние накопители старых телефонов. 2 Также её используют в устройствах, рассчитанных на поддержку карт SD или microSD, но не поддерживающих SDHC. 4

Файловая система FAT32 поддерживается многими устройствами, в том числе: жёсткими дисками, флэш-накопителями, картами памяти, памятью телефонов, цифровыми камерами, SSD-накопителями, памятью смартфонов. 2 FAT32 является фактическим стандартом и устанавливается на большинстве видов сменных носителей по умолчанию. 5

Таким образом, FAT16 в основном используется в устройствах с небольшими объёмами данных, а FAT32 — в устройствах, требующих более эффективного использования дискового пространства и совместимости с различными операционными системами и устройствами.