Один из способов безопасного подключения к MySQL из 1С — использование подключения с применением SSL. 1
Для этого необходимо установить драйвер ODBC в систему, затем настроить соединение в 1С, указав необходимые параметры, в том числе сертификаты SSL. 13
Также на форуме mista.ru пользователи рекомендуют использовать внешние источники данных для подключения к MySQL из 1С. 1
Важно помнить, что прямое подключение к базе данных 1С без использования самой системы может быть небезопасно. 2