Несколько рекомендаций, как сделать так, чтобы Windows 10 и Linux видели разные разделы SSD и не могли повредить друг другу:

• Выбрать целевой диск загрузочным в BIOS перед установкой. 1 Это поможет избежать взаимных конфликтов загрузчиков при обновлениях. 1
• Отключить монтирование ненужного диска в системе Linux. 1 Так диск с Windows не будет виден для Linux. 1
• Установить в компьютер несколько физических накопителей. 3 Если вторичные накопители отформатированы под NTFS, они будут видимы в рабочей среде любой из двух ОС. 3
• Использовать внешние SSD. 1 Это оптимальный и безопасный вариант для раздельного использования операционных систем. 1

Для точной настройки системы рекомендуется обратиться к специалисту.