Система защиты данных в ЕГИСЗ работает на основе следующих принципов:

• Юридические механизмы. 1 Устанавливают ответственность за нарушение правил использования данных, сдерживая возможных нарушителей. 1
• Организационно-управленческие методы. 1 Прописывают рамки, условия работы ресурсов, функции сотрудников, а также систему взаимоотношений между абонентами и администратором. 1
• Технические средства. 1 Блокируют свободный доступ недобросовестных пользователей к информации, «опознают» абонентов, устанавливают ограничения на доступ и редактирование сведений, обеспечивают криптографическую охрану баз данных. 1

Для защиты данных при передаче в ЕГИСЗ также используется программное обеспечение VipNet. 35 Оно обеспечивает безопасное соединение и отправку зашифрованных сведений. 3 МИС шифрует сведения в программе и передаёт их по интернету оператору ИИС, а принимающая сторона расшифровывает полученные данные. 3