Файловая система на флеш-картах определяет способ организации хранения файлов. 1 Она определяет, какого размера файлы можно хранить на диске, какие дополнительные данные кроме имени и расположения можно хранить про каждый файл, будут ли сохраняться для каждого файла разные версии, как будет восстанавливаться файл после случайного удаления, с какой скоростью будут считываться и записываться файлы на диск. 1

Некоторые файловые системы, которые используются на флеш-картах:

• FAT32. 14 Для записи данных об имени и расположении файла используется простая таблица. 1 Для хранения информации о каждом файле и кластерах, из которых он состоит, используется 32-разрядный адрес. 1 Система хранит адреса кластеров друг за другом в таблице — так компьютер узнаёт, из каких фрагментов собирать каждый файл. 1 Однако у FAT32 есть ограничение: она не поддерживает файлы размером более 4 ГБ. 4
• exFAT. 24 Файловая система, оптимизированная для USB-накопителей. 2 Она не ограничивает объём файлов и разделов, то есть на флеш-накопитель или SD-карту можно записывать файлы размером более 4 ГБ. 2 Кроме того, в exFAT снижено число перезаписей секторов, ответственных за хранение информации, что увеличивает срок службы накопителя. 2
• NTFS. 14 Вместо простой таблицы файлов в ней используется собственная база данных, в которой связано много таблиц. 1 Благодаря этому NTFS позволяет хранить файлы размером больше сотни терабайт и управлять правами доступа пользователей к разным файлам. 1

Выбор файловой системы зависит от задач и предпочтений пользователя.