Основное отличие всплывающих окон pop-under и pop-up в месте их появления: vc.ru ad-maven.com
- Pop-up — всплывающее окно, которое, как правило, появляется автоматически поверх всего содержимого интерфейса и может блокировать его. vc.ru Используется для подтверждения действия, рекламных предложений, подписки, оповещений и т. п.. vc.ru
- Pop-under — всплывающее окно, которое появляется под основным окном на заднем плане. vc.ru Пользователь увидит его после закрытия верхнего окна. vc.ru
Таким образом, pop-under не привлекает внимание пользователя до тех пор, пока активное окно не будет закрыто, и затрудняет возможность определения источника появления всплывающего окна. ru.wikipedia.org