Основные отличия разных версий шины PCI Express:

• PCI-E 2.0. 14 Удвоенная пропускная способность каждой линии передачи в каждом направлении. 1 Например, в версии PCI-E 16x, применяемой в видеокартах, пропускная способность составляет 8 ГБ/с в каждом направлении. 1
• PCI-E 3.0. 14 Изменённая схема кодирования: теперь по шине можно передать 128 бит полезной информации из 130 бит отправленной. 1 Также увеличилась скорость передачи данных до 8 GT/s. 1 Общая пропускная способность шины PCIe 3.0 в конфигурации 16x может достигать 32 ГБ/с. 1
• PCI-E 5.0. 2 При одинаковом количестве линий пропускная способность PCI-E 5.0 вдвое больше, чем у предшественника. 2 Каждая линия PCI-E 5.0 обеспечивает пропускную способность в 32 Гбит/с. 2

При этом разные версии шины PCI Express сохраняют обратную совместимость, то есть устройства с интерфейсом одной версии могут работать в слотах другой. 14