Чем отличаются командный отсек от моторного на подводной лодке?

Возможно, имелись в виду различия между центральным постом (командным отсеком) и машинным (моторным) отсеком подводной лодки.

Центральный пост — место командира корабля и служб, обеспечивающих боевое управление подводной лодки. komovsky.ru www.kpopov.ru В этом отсеке расположены приборы и устройства, с помощью которых ведётся управление движением лодки, погружением и всплытием, оружием. www.kpopov.ru

Машинный отсек связан с двигателями лодки, в нём работают мотористы и дизелисты. www.kpopov.ru Команды с боевого поста командира передаются в этот отсек через машинный телеграф — прибор, который передаёт указания. www.kpopov.ru

Таким образом, основное отличие заключается в функциях: в командном отсеке — управление лодкой, а в моторном — работа двигателей.