Система межведомственного электронного документооборота (МЭДО) и единая система межведомственного электронного взаимодействия (СМЭВ) имеют свои особенности и отличия.

МЭДО — это федеральная информационная система для автоматизированного обмена электронными документами в защищённом режиме между государственными органами. 25 Её цель — повысить эффективность управления в органах государственной власти за счёт сокращения времени прохождения документов между организациями и ведомствами, минимизации затрат на обработку и отправку документов, мониторинга исполнения поручений. 15

СМЭВ — это федеральная государственная информационная система, предназначенная для организации информационного взаимодействия между информационными системами участников СМЭВ в целях предоставления государственных и муниципальных услуг и исполнения государственных и муниципальных функций в электронной форме. 28 Иными словами, СМЭВ — это транспортная система, с помощью которой обмениваются данными различные информационные системы. 6

Таким образом, основное отличие в том, что МЭДО фокусируется на обмене электронными документами и сообщениями между государственными органами, а СМЭВ — на обеспечении информационного взаимодействия между информационными системами в рамках предоставления государственных и муниципальных услуг и функций.