Чем отличается система аутентификации в почтовом клиенте от веб-почты?

Возможно, имелись в виду различия в способах аутентификации в почтовых клиентах и веб-приложениях.

В почтовых клиентах может использоваться аутентификация по URL из писем — вариант беспарольной аутентификации. bureau.ru Для этого в письмо вкладывают ссылку для входа с секретным ключом. bureau.ru Когда пользователь кликает по такой ссылке, сервер проверяет ключ и пользователя, к которому он относится, и, если всё хорошо, запоминает пользователя. bureau.ru

В веб-приложениях традиционно используют аутентификацию по сертификатам, например, стандарта X.509. habr.com Аутентификация с помощью такого сертификата происходит в момент соединения с сервером и является частью протокола SSL/TLS. habr.com

Таким образом, в почтовых клиентах и веб-приложениях используются разные подходы к аутентификации.