Механизм мутаций в ClickHouse отличается от традиционных UPDATE тем, что предназначен для редкого и тяжёлого изменения большого количества строк в таблице. habr.com Это ресурсоёмкая операция, поэтому её не следует использовать часто. habr.com
В отличие от обновлений в OLTP-базах данных, мутации в ClickHouse не обеспечивают атомарность процесса — части подменяются изменёнными сразу после готовности, и запрос SELECT, который начинает выполняться во время мутации, видит данные из уже изменённых частей вместе с ещё не изменёнными. clickhouse.com
Также в ClickHouse есть механизм лёгких обновлений, который используется при обновлении небольшого количества данных. clickhouse.com В этом случае строки обновляются сразу, а последующие запросы SELECT автоматически возвращаются с изменёнными значениями. clickhouse.com