Автоматическое сканирование и ручное сканирование имеют свои особенности и отличия.

Автоматическое сканирование позволяет свести к минимуму ручные рутинные операции при сканировании. 2 Существуют полностью автоматические модели сканеров, у которых весь цикл сканирования происходит без участия оператора, включая переворот страницы. 2 Пользователю нужно только задать настройки и контролировать работу оборудования, всё остальное сканер делает сам. 2 В основном такие сканеры используются для оцифровки книг и сшитых документов в твёрдом переплёте. 2

Ручное сканирование — это процесс, при котором каждый листок загружается и обрабатывается человеком. 1 Для работы используется портативное устройство, которое в процессе сканирования перемещается самим пользователем. 4 Отдельный лист или сшитый документ размещается на ровной поверхности (например, на столе), сканер с помощью руки пользователя движется в максимальной близости от поверхности бумажного носителя, не спеша и с одинаковой скоростью. 4