Автоматическая загрузка программ при запуске и автозапуск в настройках отличаются по своему назначению и работе.

Автоматическая загрузка программ при запуске позволяет программам запускаться без участия пользователя сразу после включения устройства. 1 Например, в Windows стандартный список автозагрузки формируется автоматически с учётом особенностей устройства. 1 Кроме того, в операционной системе есть пользовательский список, куда можно добавить практически любую программу. 1

Автозапуск в настройках позволяет управлять приложениями, которые запускаются вместе с системой. 2 Например, в Windows для этого нужно зайти в «Пуск», выбрать «Параметры», «Приложения» и пункт «Автозагрузка» в левом меню. 2

Таким образом, основное отличие в том, что автоматическая загрузка касается самого процесса запуска программ, а автозапуск в настройках — это инструмент для управления этими процессами через специальные меню и настройки системы.