Александр Кержаков выступал за следующие клубы в своей карьере: 15

• «Светогорец» (1999–2000) — любительский клуб из Светогорска, Ленинградская область. 1
• «Зенит» (Санкт-Петербург) — с 2001 по 2006 год. 12
• «Севилья» (2007–2008) — испанский клуб. 12 В 2007 году Кержаков выиграл Кубок УЕФА, Кубок и Суперкубок Испании. 1
• «Динамо» (Москва) — в 2008–2009 годах. 12 В составе клуба Кержаков стал обладателем бронзовых медалей первенства России. 1
• «Зенит» (2010–2017) — вновь представлял этот клуб. 12 В составе «Зенита» Кержаков трижды выигрывал чемпионат России (2010, 2012, 2015), дважды становился серебряным призёром первенства страны (2013, 2014), один раз — бронзовым (2017). 1
• «Цюрих» (2016) — выступал за этот клуб на правах аренды. 1 В составе команды Кержаков выиграл Кубок Швейцарии. 1