Хакан Якин выступал за национальную сборную Швейцарии в качестве нападающего или атакующего полузащитника. 3

Некоторые достижения Якина в составе сборной:

• 11 июня 2008 года забил первый гол на 32-й минуте второго матча Швейцарии в группе А Евро-2008 против Турции, обеспечив команде преимущество со счётом 1:0. 3
• В заключительном групповом матче Швейцарии против Португалии 15 июня 2008 года Якин забил два гола во втором тайме, второй — с пенальти, и обеспечил команде первую в истории победу на чемпионате Европы УЕФА со счётом 2:0. 3
• Принял участие в семи из десяти отборочных матчей сборной Швейцарии к чемпионату мира по футболу 2010 года, дважды выйдя в стартовом составе и выйдя на замену в пяти матчах, забив один гол в первом отборочном матче Швейцарии против Израиля. 3

Якин объявил о завершении карьеры в сборной Швейцарии 4 октября 2011 года, за которую провёл 87 матчей и забил 20 голов. 13