Раджа Наингголан провёл 30 матчей за сборную Бельгии и забил 6 голов в период с 2009 по 2018 год. 25

Некоторые факты из карьеры Наингголана в составе национальной команды:

• 5 марта 2014 года забил первый гол за сборную в товарищеском матче против команды Кот-д’Ивуара (2:2). 1
• Был в числе кандидатов на попадание в состав сборной Бельгии на чемпионате мира 2014 года в Бразилии, но не попал в окончательную заявку. 1
• На чемпионате Европы 2016 года во Франции в третьем матче группового этапа дальним ударом в конце матча принёс бельгийцам победу над сборной Швеции (1:0). 1
• В августе 2017 года заявил о своём уходе из сборной Бельгии и раскритиковал главного тренера национальной команды Роберто Мартинеса. 1
• После того, как Наингголан не попал в заявку сборной на чемпионат мира 2018 года, он объявил об окончательном уходе из национальной команды. 4