Некоторые отличия между гарнизонными военными судами и гражданскими судами общей юрисдикции:

• Подсудность дел: гарнизонные военные суды рассматривают дела, касающиеся только военнослужащих. 4 Суды общей юрисдикции рассматривают дела, которые не ограничены военной сферой. 5
• Состав суда: в гарнизонных военных судах гражданские и административные дела рассматривает судья единолично либо, в случаях, предусмотренных законом, коллегия из трёх судей. 25 Уголовные дела рассматривает судья единолично, либо коллегия из трёх судей, либо суд с участием присяжных заседателей. 25
• Место создания: гарнизонные военные суды создаются по территориальному принципу, по месту дислокации воинских частей и учреждений Вооружённых Сил РФ, других войск, воинских формирований и органов. 23 Суды общей юрисдикции создаются в судебном районе. 1
• Процедура обжалования: в отличие от районных судов, гарнизонные военные суды не осуществляют процедуру обжалования, поскольку мировые судьи не обладают юрисдикцией в отношении военнослужащих. 4