Основные отличия между руководителем следственного органа и прокурором заключаются в их функциях и полномочиях:

1. Руководитель следственного органа осуществляет процессуальное руководство предварительным расследованием, обладает контрольными полномочиями над следственной деятельностью и производством предварительного следствия. 45 Он вправе возбудить уголовное дело, принять его к своему производству и произвести предварительное следствие в полном объёме. 17
2. Прокурор осуществляет уголовное преследование, а также надзор за процессуальной деятельностью органов дознания и предварительного следствия. 24 Он может возбудить производство об административном правонарушении, потребовать привлечения лиц, нарушивших закон, к ответственности, предостеречь о недопустимости нарушения закона. 6

Таким образом, руководитель следственного органа влияет на ход и результаты расследования, в то время как прокурор осуществляет надзор за законностью. 28