Некоторые основные отличия автономных некоммерческих организаций (АНО) от государственных учреждений:

• Учредители: учредителями АНО могут быть физические, юридические лица, Российская Федерация или субъекты РФ. 1 Государственные учреждения создаются РФ, субъектом РФ или муниципальным образованием. 13
• Цель создания: АНО нацелены на оказание услуг в разных сферах (образования, науки, здравоохранения, социальной защиты, культуры и других). 1 Государственные учреждения создаются для реализации определённых полномочий органов государственной власти. 34
• Ответственность: АНО отвечают по своим долгам, а собственник учреждения не несёт ответственность за АНО. 1 Государственные учреждения отвечают по своим обязательствам всем находящимся у них на праве оперативного управления имуществом. 2
• Собственность: имущество АНО формируется на основе добровольных взносов, а государственные учреждения не являются собственниками имущества, оно находится на правах оперативного управления. 1
• Деятельность: АНО могут вести предпринимательскую деятельность для осуществления целей организации. 1 Государственные учреждения осуществляют свою деятельность в соответствии с предметом и целями, определёнными законодательством и учредительными документами. 3
• Финансовое обеспечение: АНО финансируются в виде субсидий из бюджета и иных не запрещённых федеральными законами источников. 25 Государственные учреждения финансируются за счёт средств бюджета на основании бюджетной сметы. 2