Разница между регистрацией основной компании и её филиалов в налоговой системе заключается в особенностях учёта и налогообложения:

1. Регистрация основной компании. 510 Для неё подаётся заявление по форме Р11001, и налоговая добавляет данные о создании юридического лица в ЕГРЮЛ 3510.
2. Регистрация филиалов. 26 Об открытии филиала нужно в течение месяца сообщить в налоговую инспекцию по форме Р13014. 1 ИФНС включит сведения о филиалах в ЕГРЮЛ и поставит на учёт. 1 Так как филиал не является самостоятельным юридическим лицом, он не подлежит государственной регистрации, но обязательна его постановка на налоговый учёт по месту нахождения в течение 30 дней с момента создания. 4

При этом филиалы не уплачивают НДС самостоятельно, все расчёты по налогу производит головная организация. 1 Региональную часть налога на прибыль нужно распределить между головной компанией и её филиалами пропорционально долям прибыли. 1 Отчётность по филиалу чаще всего сдает головная организация. 1 Если филиал выделен на отдельный баланс и имеет свой расчётный счёт, то расчёт по взносам, начисленным работникам подразделения, сдает филиал. 1