Разница между протоколом согласования и дополнительным соглашением к договору заключается в их функциях и условиях составления.

Протокол согласования — это документ, который является приложением к договору и фиксирует стоимость услуг, работ или товаров, не внося изменений в основной документ. 1 Его составляют, когда невозможно определить окончательную стоимость договора на этапе его заключения. 1 Протокол не имеет строго обязательного назначения, его можно заменить дополнительным соглашением к договору. 1

Дополнительное соглашение — это документ, который вносит изменения в уже действующий и подписанный ранее договор. 3 Он готовится к уже совершённой сделке, оговаривает исправления в подписанное и вступившее в действие соглашение. 2 Также дополнительное соглашение может иметь целью расширение условий по договору или продление его действия. 3 В таком документе всегда указывается, с какого момента (в виде конкретной даты или формулировкой «с момента подписания») он начинает действовать. 3