Разница между госпошлиной при регистрации через МФЦ и Росреестр заключается в её размере и порядке уплаты:

1. При регистрации через МФЦ госпошлина за регистрацию юридических лиц и индивидуальных предпринимателей не уплачивается, если документы подаются в электронной форме через МФЦ. 7 В этом случае МФЦ перенаправляет документы в регистрирующий орган в форме электронных документов, подписанных усиленной квалифицированной электронной подписью. 7
2. При регистрации через Росреестр размер госпошлины зависит от статуса плательщика (физическое или юридическое лицо), а также от типа недвижимости и характера регистрационных действий. 14 Например, в 2024 году для физических лиц при регистрации права собственности на квартиру или жилой дом госпошлина составляет 2000 рублей, на земельный участок, предназначенный для ведения личного подсобного или дачного хозяйства, огородничества, садоводства или строительства дома, — 350 рублей, при государственной регистрации ипотеки — 1000 рублей. 12

Таким образом, при регистрации через МФЦ госпошлина не уплачивается, а при регистрации через Росреестр её размер может отличаться в зависимости от конкретного случая.