Разница между федеральными министерствами, службами и агентствами в системе федеральных органов исполнительной власти заключается в их функциях:

1. Федеральные министерства выполняют функции по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в установленной сфере деятельности. 15
2. Федеральные службы осуществляют функции по контролю и надзору в установленной сфере деятельности, а также специальные функции в области обороны, государственной безопасности, защиты и охраны государственной границы Российской Федерации, борьбы с преступностью, общественной безопасности. 1
3. Федеральные агентства осуществляют в установленной сфере деятельности функции по оказанию государственных услуг, по управлению государственным имуществом и правоприменительные функции, за исключением функций по контролю и надзору. 1

Таким образом, основное различие заключается в том, что министерства осуществляют нормативно-правовое регулирование, службы — контрольно-надзорные функции, а агентства — оказывают услуги от лица государства. 79