Нет, это не является ошибкой, если в трудовой книжке увольнение генерального директора подпишет учредитель. 1

Заверить запись об увольнении руководителя организации может тот же, кто подписал приказ об увольнении. 14 Например, это может быть сам генеральный директор или председатель общего собрания участников (собственников). 14 Также такую запись вправе заверить работник, ответственный за ведение трудовых книжек. 14