Да, договор, подписанный с протоколом разногласий, может считаться заключённым с момента урегулирования сторонами разногласий по нему (акцепта протокола разногласий). 5
Таким моментом считается день получения стороной, подписавшей договор с протоколом разногласий и направившей его другой стороне, полного и безоговорочного согласия (акцепта) другой стороны заключить договор на условиях, изложенных в протоколе разногласий. 5
Однако если, несмотря на факт подписания текста договора и протокола разногласий к нему, сторонами не были согласованы все существенные условия договора, он, несмотря на подписи, будет считаться незаконченным. 2 Это следует из п. 1 ст. 432 ГК РФ. 2
Для получения более точной информации о конкретной ситуации рекомендуется обратиться к юристу.