В слове «глубинный» пишется две буквы «Н» из-за наличия двух суффиксов — «ИН» и «Н». 1

Слово образовано от существительного «глубина» суффиксальным способом: «глуб-» — корень, «-ин-» — суффикс, «-ый» — окончание, основа слова — «глубин-». 2 При образовании прилагательного к основе существительного добавляется суффикс «Н». 2 Так как на конце основы стоит согласная «Н», добавляя суффикс «Н», получаем два «НН». 2